J Comput Biol: Egy új módszer megjósolni a cél a vírusellenes gyógyszerek vagy vakcinák

A legígéretesebb vírusellenes szerek vagy vakcina célok előrejelzésére szolgáló új módszer a vírusos glikoproteinek által az elismerés és a gazdasejtekhez való kötődés során tapasztalt konformációs változásokon alapul. Ez az előrejelzési módszer a legnagyobb szabad energiamotívumú hidrogénkötés fő láncára irányul. Kapcsolódó kutatási eredmények teszik közzé a Journal of Computational Biology, amely egy lektorált folyóirat által közzétett Mary Ann Liebert.

Robert Penner a Francia Felsőoktatási Intézet (Bures-sur-Yvette) és az UCLA Matematikai Biológia Rene Thom-jának elnöke. Ő a szerzője ennek a cikknek című "Gerinc szabad energia becslő alkalmazott vírusos glikoproteinek"

Kép forrása: Mary Ann Liebert, Inc., kiadók

Ahogy a vírus belép a gazdasejtbe és felszívódik, a vírus általában erőteljes rekombináción megy keresztül, amely fúziós / infiltrációs motívumot képez. Penner javasolt egy általános módszert a vírusglikoproteinek háromdimenziós szerkezetéből származó, rendkívül konformációsan aktív maradványok előrejelzésére. A módszer magában foglalja a fehérje hidrogénkötéseinek elemzését és a megfelelő jellemzők szabad energiakülönbségeinek kiszámítását, hogy meghatározzuk azokat a területeket, ahol a konformációs változás a legvalószínűbb. Az ebben a dokumentumban javasolt módszert jelenleg a SARS CoV-2 tüske glikoproteinjére használják, ami COVID-19-et okozhat.

Misha Gromov, az Institute of Advanced Science és a New York-i Egyetem azt mondta: "A matematikai ötlet közvetlenül vezet a gyakorlati jelentése, ami egyszerűen egy csoda, de a jutalom hatalmas, mert előfordul Maxwell elektromágneses mező elmélet-ez hozza a rádió és a televízió , megnyitja az ajtót az elméleti számítások a mi digitális világban. " Ő egy híres matematikus és Ábel-díjas (más néven a Nobel-díj a matematika). "Csak akkor, ha a szerző egy kiváló matematikus, hanem egy széles tudományos horizont, egy ilyen ötlet lehetséges, és ez ritka között a legjobb matematikusok korunk. Robert Penner egy ilyen ritka matematikus, azt találta, hogy a módszer a fehérje szerkezet e minta eltér bárki más a világon, és a fehérje szerkezete minta eredménye a tiszta matematikai gondolkodás. Ez a módszer valószínűleg szerepet játszik, és felgyorsítja a fejlesztés az anti-vírus gyógyszerek vagy vakcinák. De ezt csak a kísérletek tudják bizonyítani. "(Bioon.com)

Forrás: